Kardinál Michael Czerny je pôvodom Európan, formáciou Severoameričan. Narodil sa 18. júla 1946 v Brne, vtedajšom Československu. O dva roky neskôr sa jeho rodina presťahovala do Montréalu v Kanade. Tam tiež navštevoval Loyola High School a v roku 1963 po ukončení štúdií vstúpil do kanadskej anglofónnej provincie Tovaryšstva Ježišovho. Na kňaza bol vysvätený 9. júna 1973. Obhájil doktorát zo sociálnych vied na tému vzťahu medzi sociálnym myslením a teológiou v rámci interdisciplinárneho študijného programu na univerzite v Chicagu.
O rok neskôr založil v Toronte jezuitské Centrum pre vieru a sociálnu spravodlivosť, ktorého čelom stál do roku 1989, kedy sa po vražde šiestich spolubratov, ku ktorej došlo v noci 16. novembra na Stredoamerickej univerzite v San Salvadoru, ponúkol ako ich nástupca. Ešte predtým strávil niekoľko mesiacov v Československu a vo Francúzsku v komunite Archa, založenej Jeanom Vanierom.
Po odchode do Strednej Ameriky pôsobil v rokoch 1990–1991 ako riaditeľ Inštitútu pre ľudské práva UCA a v roku 1991 zastával úrad vicerektora univerzity. Svojím prínosom sa zapísal tiež v OSN, keď sa v role prostredníka zúčastnil rokovaní, ktoré viedli k ukončeniu vleklé občianskej vojny (1980–1992) v El Salvadoru.
Po desať rokov (do roku 2002) pôsobil ako sekretár v rámci Sekretariátu pre sociálnu spravodlivosť pri generálnej kurií jezuitov v Ríme. V roku 1995 sa zúčastnil 34. generálnej kongregácie Tovaryšstva založeného sv. Ignácom z Loyoly a bol členom komisie OSN pre vyšetrovanie situácie na Haiti v období krízy, ktorá nasledovala po vojenskom prevrate zvoleného prezidenta.
Zo Strednej Ameriky odišiel otec Czerný do Afriky (2002–2010), kde založil a viedol Africkú jezuitskú sieť pomoci podporujúcu afrických jezuitov zapojených do hľadania pomoci na pandemické šírenie vírusu HIV. V tomto období vyučoval na Katolíckej univerzite Východnej Afriky v Nairobi a spolupracoval s Biskupskou konferenciou Kene.
V roku 2009 ho vďaka oboznámenosti s africkým svetom pápež Benedikt XVI. vymenoval expertom na zvláštnej biskupskej synode pre tento kontinent a v roku 2010 bol definitívne povolaný do Ríma ako konzultant Pápežskej rady Iustitia et Pax. Keď v roku 2016 došlo k združovaniu pápežských rád, bola „Iustitia et Pax“ zahrnutá do Úradu pre integrálny ľudský rozvoj. Pápež František, ktorý si vyhradil priame vedenie sekcie zaoberajúcej sa výslovne otázkou utečencov a migrantov, vymenoval otca Czerného za svojho spolupracovníka v role podsekretára.
V októbri 2018 sa otec Czerný zúčastnil 15. riadneho zasedania biskupskej synody na tému „Mladí, viera a rozlišovanie povolania“ a bol vymenovaný za zvláštneho sekretára synodálneho zasedania pre Amazonku, ktoré prebehlo vo Vatikáne od 6. do 27. októbra 2019. Svoju rolu vníma ako službu domorodým národom a obranu stále viac drancovaného životného prostredia v tomto regióne. Prispel tiež do knihy vydanej Pápežskou komisiou pre latinskú Ameriku a nazvanej „Invázia ľudových hnutí. „Rerum novarum“ našej doby“.
V predvečer kardinálskej konzistórie, v piatok 4. októbra 2019, obdržal v bazilike sv. Petra vkladaním rúk pápeža Františka biskupské vysvätenie spolu s trojicou apoštolských nunciov. Za titulárny biskupský stolec mu bol pridelený Benevento, so zvláštnym osobným arcibiskupským titulom. Jeho kardinálskym titulom sa stala diakónia sv. Archandela Michala v rímskej štvrti Pietralata. Do kardinálskeho znaku si zvolil okrem jezuitského emblemu s planúcim slnkom a písmenami IHS aj bárku na vlnách so štvorkou čiernych siluet.
